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학회에서는 2009년 6월 현재 17개 분과연구회가 설치되어 각 연구회 별로 국내 및 국제학술행사, 주제별세미나 등의 개최 및 소식지, 논문집 등을 발간하고 있습니다.
정보보호연구회 운영위원장 : 서창호 교수(공주대)
 
정보보호연구회는 2000년 4월 28일 대구 효성카톨릭 대학교에서 개최한 정보과학회 춘계학술발표회에서 정보보호에 관한 관심과 연구가 최근 들어 중요한 이슈로 대두되었지만 정보과학회 산하에 전문 연구회가 없는 현실에 공감을 한 약 20-30여명의 교수 등이 정보보호 분야의 학술 및 연구 활동의 활성화를 위해서 연구회를 발족하기 위한 발기인 모임을 가지고, 연구회 추진 위원회(추진위원장: 조유근 서울대 교수)를 구성하고, 추진 위원회에서 그 해 6월에 정보과학회 "정보보호 연구회"를 등록하였다. 그 후에 2000년 7월 20일 KAIST에서 창립총회를 갖고, KAIST의 이광형 교수를 연구회 운영위원장으로 선임함으로써 연구회의 본격적인 활동이 시작되었다.
정보보호연구회는 정보보호분야에 관심을 가진 정보과학회 회원으로 구성되며, 상호 정보교환을 통한 학술 및 연구 활동의 활성화 및 회원 상호간의 친목을 그 목표로 하여 활동 중이다. 연구회가 출범한지 얼마 되지 않지만, 시대적 요구와 그간 많은 회원들의 왕성한 학술연구 활동으로 정보과학회 주최 봄, 가을 학술발표회에서의 관련 분야의 발표논문수가 분과연구회가 설립되기 전에 비하여 크게 늘어나는 추세이다. 앞으로 정보보호 연구회는 학술 발표회를 통해서 정보보호의 중요성을 인식시키며, 많은 연구자들이 배출되어 연구의 활성화로 정보보호 메카니즘을 위한 기반기술, 시스템 보호기술, 여러 응용분야의 보안을 위한 보안기술 등 여러 정보보호분야에 학술적 수준을 높이는 데 크게 기여하고자 한다.
2000.4
 
대구효성카톨릭대에서 발기인 모임 및 추진위원회 결성
2000.6 정보과학회에 연구회(정보보호연구회)등록
2000.7 초대 정보보호연구회 운영위원장 선출(창립총회 개최, KAIST)
2000.10 숙명여대에서 임원진 결성
2001.2
 
제 1회 정보보호 학술논문 발표회 개최(이화여대)
(튜토리얼 3편, 학술논문 14편, 참가자 96명)
2001.4 정보보호 연구회지 창간호 발간
2001.9 정보보호 연구회지 제1권 1호 발간
2002.4 정보보호 연구회지 제2권 1호 발간
2002.10 제 2대 정보보호연구회 운영위원장 선출(수원대에서 정기총회)
2002.11 정보보호 연구회지 제2권 2호 발간
2003.4 정보보호 연구회지 제3권 1호 발간
2003.8 아주대학교에서 학술발표회 개최
2004.4 정보보호 연구회지 제4권 1호 발간
2004.7 경북대학교에서 학술발표회 개최
2004.10 서울대에서 정기총회
2005.9 정보보호진흥원 원장 초청강연 및 광주·전남 정보보호 교수 모임
2005.12 정보보호 연구회지 제5권 1호 발간
2007.1 제4대 정보보호연구회 운영위원장 선출
2009.1 제5대 정보보호연구회 운영위원장 선출
2010.1 제6대 정보보호연구회 운영위원장 선출
2011.1 제7대 정보보호연구회 운영위원장 선출